A Resolução de Mesa Nº 978 de 16 de junho de 2010 regulamentou a premiação a ser concedida aos jovens cientistas das escolas de ensino médio e/ou da educação profissional de nível técnico do Estado com as melhores pontuações na MOSTRATEC. O Prêmio  Jovem Cientista foi instituído pela Resolução 3.046 de outubro de 2009.

O Prêmio Jovem Cientista será conferido a três estudantes que obtiverem melhor pontuação na classificação dos trabalhos individuais da Mostra Internacional de Ciência e Tecnologia - MOSTRATEC, promovida pela Fundação Escola Técnica Liberato Salzano Vieira da Cunha.